banner

Блог

Jun 01, 2023

Стратегии стабилизации и нормализации мочи способствуют объективному анализу содержания ЭВ в моче.

Том 12 научных докладов, номер статьи: 17663 (2022 г.) Цитировать эту статью

1378 Доступов

3 цитаты

1 Альтметрика

Подробности о метриках

Моча представляет собой идеальный источник неинвазивных диагностических маркеров. Некоторые внутренние и методологические проблемы по-прежнему препятствуют реализации его полного потенциала в качестве жидкого субстрата для биопсии. В отличие от крови, концентрация мочи зависит от питания, гидратации и факторов окружающей среды. Моча обогащается ЭВ из мочеполового тракта, а ее сохранение, очистка и нормализация могут внести погрешность в анализ подгрупп ЭВ при меж- и внутрииндивидуальных сравнениях. В настоящем исследовании оценивались методы, которые уменьшают такие систематические ошибки, такие как подходящее и осуществимое хранение мочи, оптимальный одноэтапный метод очистки ЭВ для извлечения белков и РНК из небольших объемов мочи и метод нормализации для количественного анализа РНК ЭВ мочи. Ультрацентрифугирование, химическое осаждение и иммуноаффинность использовались для выделения ЭВ из мочи здоровых доноров, которая хранилась замороженной или при комнатной температуре до 6 месяцев. В образцах мочи сравнивались различные биохимические параметры мочи и параметры EV, включая количество частиц и содержание белка. С этой целью были проведены анализ отслеживания наночастиц (NTA) и оценка белка с помощью анализов BCA, ELISA и WB. Эти измерения коррелировали с относительным содержанием выбранных мРНК и микроРНК EV, оцененных с помощью RT-PCR и ранжированных по способности отражать и корректировать изменения содержания EV в продольных образцах мочи. Все методы очистки позволяли извлекать и последующий анализ ВВ всего из 1 мл мочи. Наши результаты подчеркивают долгосрочную стабильность РНК ЭВ при хранении мочи при комнатной температуре, а также отличную корреляцию содержания ЭВ в моче с некоторыми рутинно измеряемыми биохимическими показателями, такими как общий белок мочи и альбумин, но не креатинин, который обычно используется для нормализации мочи. Сравнительная оценка мРНК и микроРНК в изолятах ЭВ выявила специфические РНК, в частности RNY4 и небольшую панель микроРНК, уровни которых хорошо отражают вариации ЭВ между образцами и, следовательно, полезны в качестве возможных постаналитических нормализаторов содержания РНК ЭВ. Мы описываем некоторые реалистичные решения по обработке и нормализации мочи для объективного считывания результатов исследований биомаркеров EV, а также рутинных клинических отборов проб и диагностики, обеспечивая исходные данные для разработки более крупных проверочных исследований с использованием EV мочи в качестве биомаркеров для конкретных состояний и заболеваний.

Моча является привлекательным и доступным источником потенциально ценных диагностических маркеров для ряда клинических состояний, в первую очередь тех, которые влияют на урогенитальный тракт, таких как заболевания или травмы почек, а также рак урогенитальных органов. Кроме того, биомаркеры мочи показали потенциальную возможность выявления неурологических патологий1,2, таких как другие виды рака (например, рак молочной железы или легких), метаболические и эндокринные расстройства (например, диабет), воспалительные состояния (например, атеросклероз и остеоартрит) и даже нейродегенеративные или нейропсихиатрические заболевания. заболевания. Использование анализов мочи для диагностики заболеваний является древней практикой (например, обнаружение глюкозы у больных диабетом путем ее дегустации или привлечения муравьев или обнаружение альбумина как индикатора заболевания почек с помощью «пенного теста») и остается основным компонентом следственной медицины на протяжении 20-го и начала XXI века3. С появлением современных методов омики обнаружено множество компонентов мочи, количественные и качественные изменения которых, как ожидается, будут иметь диагностическую и прогностическую ценность в клинической сфере.

Парадоксально, но моча до сих пор недостаточно изучена как полностью неинвазивный источник биомаркеров жидкой биопсии, которые можно использовать в долгосрочной перспективе для диагностики и мониторинга. Этот парадокс обусловлен особыми особенностями этой биожидкости, а также методологическими препятствиями, которые все еще мешают переходу кандидатов в биомаркеры к количественной прерогативе валидации и реализации диагностических анализов.

 80% abundance of small RNAs (miRNA) in all samples, but RNA content resulted too low to enable accurate Qubit 2.0 measurements, with some samples containing < 250 pg/μl. The latter was expected as our samples were obtained from urine volumes as low as 1 ml11. Therefore, we could not use a fixed RNA amount, but have decided to use an equal original urine volume for input normalization n amplification reactions. Such decision is in line with the common practice in diagnostic sampling22. MiRNAs are among the exosome cargo molecules that have elicited substantial interest and have been early approached for potential clinical interest. Different miRNAs have been described as associated to urinary vesicles in healthy or diseased subjects6,12,23,24,25. For the purpose of stability testing in this study we have first picked up several miRNAs commonly expressed in EVs, also in urine23,25. Within 1 month of storage, notoriously abundant miRNAs such as miR-21, 16 and 210 are successfully amplified (with Ct values ranging between 23 and 33) from exosome-sized vesicles purified from 1 ml of urine and showed high stability in samples preserved at RT (Fig. 3). The content of analyzed miRNAs was quantified as relative expression to that of a reference sample with known and constant RNA input (EV RNA from LnCAP cell culture)13,14. As expected, miR-451 resulted low abundant but was still revealed in all the samples tested. Increased stability of EV RNAs upon storage at RT was confirmed also after 6 months, in particular in UC samples. All three employed methods gave the material that can be reliably amplified and quantified, with the lowest miRNA expression obtained from IP samples. This result has been anticipated by an acknowledged fact that immunoaffinity selects for EV subpopulations, trading off the yield for specificity and purity. Interesting exception is observed for miRNA 210 that resulted highly enriched in IP samples (Fig. 3)./p>

ДЕЛИТЬСЯ